Data Dictionary

ฟิลด์ ประเภท ป้ายกำกับ รายละเอียด
No numeric (override) ์No.

ลำดับที่
Sample ID text (override) Sample ID

รหัสประจำตัวอาสาสมัคร 8 หลัก
Received Date timestamp (override) Received Date

วันที่ได้รับ DNA
SEQ Date timestamp (override) SEQ Data

วันที่ส่งมอบข้อมูล FASTQ
QC Date timestamp (override) QC Date

วันที่รายงานผล QC
Clean Bases (Gbp) numeric (override) Clean Bases

จำนวน base-paired โดยรวม
GC (%) numeric (override) GC (%)

ปริมาณของ GC bases โดยคิดเป็นเปอร์เซ็น
Q20 (%) numeric (override) Q20 (%)

ปริมาณของ bases ที่มี Q ตั้งแต่ Q20 ขึ้นไป โดยคิดเป็นเปอร์เซ็น
Q30 (%) numeric (override) Q30 (%)

ปริมาณของ bases ที่มี Q ตั้งแต่ Q30 ขึ้นไป โดยคิดเป็นเปอร์เซ็น
Map rate (%) numeric (override) Map rate (%)

Mapping Rate คิดเป็นเปอร์เซ็นของ bases ที่ไป Align และ match กับ Reference (GRCh38 + Decoy genomes)
Unique rate (%) numeric (override) ๊Unique rate (%)

Unique Rate คิดเป็นเปอร์เซ็นของ reads ที่ไป Align และ match ได้เพียงตำแหน่งเดียวเมื่อเทียบกับ Reference (GRCh38 + Decoy genomes)
Dup (%) numeric (override) Dup (%)

Duplication rate คิดเป็นเปอร์เซ็นของ bases ที่ไป Align และ match กับ Reference (GRCh38 + Decoy genomes) และมีการพบ read ที่ไป align ได้ซ้ำกัน
Mean Cov numeric (override) Mean Cov

Mean Coverage เป็นค่าเฉลี่ยของจำนวน reads เทียบกับ human reference genome
SD Coverage numeric (override) SD Cov

SD Coverage เป็นค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของปริมาณ reads เมื่อเทียบกับ human reference genome
Coverage (%) 1X numeric (override) Coverage (%) 1x

เป็นค่า Coverage ของ reads เมื่อ align เทียบกับ reference genome และมีปริมาณตั้งแต่ 1 read ขึ้นไป โดยคิดเป็น % เมื่อเทียบกับทั้งจีโนม
Coverage (%) 10X numeric (override) Coverage (%) 10x

เป็นค่า Coverage ของ reads เมื่อ align เทียบกับ reference genome และมีปริมาณตั้งแต่ 10 reads ขึ้นไป โดยคิดเป็น % เมื่อเทียบกับทั้งจีโนม
Coverage (%) 20X numeric (override) Coverage (%) 20x

เป็นค่า Coverage ของ reads เมื่อ align เทียบกับ reference genome และมีปริมาณตั้งแต่ 20 reads ขึ้นไป โดยคิดเป็น % เมื่อเทียบกับทั้งจีโนม
Coverage (%) 30X numeric (override) Coverage (%) 30x

เป็นค่า Coverage ของ reads เมื่อ align เทียบกับ reference genome และมีปริมาณตั้งแต่ 30 reads ขึ้นไป โดยคิดเป็น % เมื่อเทียบกับทั้งจีโนม

ข้อมูลเพิ่มเติม

ฟิลด์ ค่า
นามสกุลของไฟล์ XLSX
เงื่อนไขในการเข้าถึงข้อมูล
หน่วยที่ย่อยที่สุดของการจัดเก็บข้อมูล
วันที่เริ่มต้นสร้าง
วันที่ปรับปรุงข้อมูลล่าสุด
สร้างในระบบเมื่อ 5 กันยายน 2569
ปรับปรุงครั้งล่าสุดเมื่อ 9 กันยายน 2569