@prefix dcat: <http://www.w3.org/ns/dcat#> .
@prefix dct: <http://purl.org/dc/terms/> .
@prefix foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/> .
@prefix hydra: <http://www.w3.org/ns/hydra/core#> .
@prefix spdx: <http://spdx.org/rdf/terms#> .
@prefix vcard: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#> .
@prefix xsd: <http://www.w3.org/2001/XMLSchema#> .

<https://data.genomicsthailand.com/catalog.n3?page=1> a hydra:PagedCollection ;
    hydra:first "https://data.genomicsthailand.com/catalog.n3?page=1" ;
    hydra:firstPage "https://data.genomicsthailand.com/catalog.n3?page=1" ;
    hydra:itemsPerPage 100 ;
    hydra:last "https://data.genomicsthailand.com/catalog.n3?page=1" ;
    hydra:lastPage "https://data.genomicsthailand.com/catalog.n3?page=1" ;
    hydra:totalItems 20 .

<https://cohort.genomicsthailand.com> a foaf:Document .

<https://data.genomicsthailand.com> a dcat:Catalog ;
    dct:description "ชุดข้อมูลในโครงการจีโนมิกส์ประเทศไทย" ;
    dct:language "th" ;
    dct:modified "2026-09-09T15:14:57.843108"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "Genomics Thailand Data Catalog" ;
    dcat:dataset <https://data.genomicsthailand.com/dataset/075bc0ab-f67c-41c7-b40e-09531fec3f63>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/1290261d-dd69-4c78-affe-b6181da39e17>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/280287e3-5bb0-4e74-b4d7-31a5fea692df>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/2bd0a79a-0753-4b30-b24a-c378d159ec04>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/420abf2b-6351-4fe3-8a7d-d5dbf8ad67db>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/5979bc2c-708e-4a0e-a808-c1d554eb5b61>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/5ccd8451-0971-4955-8974-e3539ecaaf98>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/5d683012-6271-473b-b19e-eb23f1f6016d>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/6a1a5bf8-bae3-4b43-9d4f-226b92f94ff1>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/7801e1c8-c8fb-4e38-bc4a-f3f6900052e2>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/79952607-1c19-4a78-b16d-f84ea94a99a5>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/828b8d9c-68b7-4042-8d5f-83da10f46024>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/97dc8c33-d2af-4d75-828c-3e9b8c98b993>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/caa0f4f7-d88d-4bc5-b5bf-6f467b0598f4>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/decc3669-a189-49cd-80f7-b463d6941184>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/e22d7806-6bff-4e5d-b29e-de7705a297b7>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/e895fdc3-0853-40c8-a5b2-64ba8b274add>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/f3bf03c8-9c0f-4c36-92a0-53742064c8ab>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/f810c59f-8525-4d07-a735-06fdbc922f66> ;
    foaf:homepage <https://data.genomicsthailand.com> .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/075bc0ab-f67c-41c7-b40e-09531fec3f63> a dcat:Dataset ;
    dct:description "เป็นข้อมูลพื้นฐานของอาสาสมัครในโครงการจีโนมิกส์ประเทศไทยที่มีการลงทะเบียนเข้าร่วมโครงการผ่านระบบ Enrollment" ;
    dct:identifier "075bc0ab-f67c-41c7-b40e-09531fec3f63" ;
    dct:issued "2026-04-26T06:50:59.492710"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-04-28T09:35:00.357460"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "ข้อมูลสถิติประชากร (Demographics data)" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:keyword "demographics",
        "ระบบลงทะเบียนอาสาสมัคร" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/1290261d-dd69-4c78-affe-b6181da39e17> a dcat:Dataset ;
    dct:description "เป็นข้อมูลความหลากหลายทางพันธุกรรมในกลุ่มยีน Pharmacogenomics จากอาสาสมัคร 50,000 ราย ผ่านการประมวลผลโดยใช้ซอฟต์แวร์ HLA-HD" ;
    dct:identifier "1290261d-dd69-4c78-affe-b6181da39e17" ;
    dct:issued "2026-04-28T07:37:01.438724"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-04-28T09:15:45.996193"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "Pharmacogenomics Diplotype (Excel)" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:keyword "Diplotype",
        "HLA",
        "PGx",
        "Pharmacogenomics" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/280287e3-5bb0-4e74-b4d7-31a5fea692df> a dcat:Dataset ;
    dct:description "เป็นชุดข้อมูลการตรวจสอบคุณภาพของการถอดรหัสพันธุกรรมทั่วจีโนมจำนวน 50,000 ราย โดยใช้ซอฟต์แวร์ SOAPNuke, SAMtools และ GATK CollectWGSMetrics" ;
    dct:identifier "280287e3-5bb0-4e74-b4d7-31a5fea692df" ;
    dct:issued "2026-04-26T07:16:22.027895"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-09-09T14:46:18.841778"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "WGS Quality" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:distribution <https://data.genomicsthailand.com/dataset/280287e3-5bb0-4e74-b4d7-31a5fea692df/resource/57331823-8df4-4c2f-87e2-644ec280f666> ;
    dcat:keyword "Data QC",
        "WGS" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/280287e3-5bb0-4e74-b4d7-31a5fea692df/resource/57331823-8df4-4c2f-87e2-644ec280f666> a dcat:Distribution ;
    dct:description "ข้อมูลคุณภาพของ WGS ทั้ง 50,000 ราย" ;
    dct:format "XLSX" ;
    dct:issued "2026-09-05T18:47:39.015844"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-09-09T14:46:18.857317"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "GeTH50k_WGS_QC.xlsx" ;
    spdx:checksum [ a spdx:Checksum ;
            spdx:checksumValue "6f6ae9bbe201d79cdcfcad0e9720124f"^^xsd:hexBinary ] ;
    dcat:accessURL <https://data.genomicsthailand.com/dataset/280287e3-5bb0-4e74-b4d7-31a5fea692df/resource/57331823-8df4-4c2f-87e2-644ec280f666/download/geth_wgs_qc.xlsx> ;
    dcat:byteSize "5924235"^^xsd:nonNegativeInteger ;
    dcat:mediaType "application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/2bd0a79a-0753-4b30-b24a-c378d159ec04> a dcat:Dataset ;
    dct:description "รายชื่อโครงการวิจัยที่ได้รับการสนับสนุนจาก สวรส.​ ภายใต้แผนปฏิบัติการบูรณาการจีโนมิกส์ประเทศไทยตั้งแต่ปี 2563 จนถึงปัจจุบัน" ;
    dct:identifier "2bd0a79a-0753-4b30-b24a-c378d159ec04" ;
    dct:issued "2026-04-28T07:43:51.034377"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-05-04T01:36:43.600260"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "รายชื่อโครงการวิจัยภายใต้แผนวิจัยจีโนมิกส์ประเทศไทย" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:keyword "Research project",
        "WGS" ;
    dcat:landingPage <https://research.genomicsthailand.com> .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/420abf2b-6351-4fe3-8a7d-d5dbf8ad67db> a dcat:Dataset ;
    dct:description "เป็นฐานข้อมูลความหลากหลายทางพันธุกรรมในประชากรไทย นำเสนอในรูปแบบฐานข้อมูลออนไลน์ โดยเป็นการเก็บรวบรวมความหลากหลายทางพันธุกรรมที่พบจากข้อมูลประชากรไทยจำนวน 50,000 ราย มีการประมวลผลในรูปแบบความถี่อัลลีล และความถี่จีโนไทป์ รวมทั้งมีการเปรียบเทียบข้อมูลกับฐานข้อมูลสาธารณะอื่น ๆ" ;
    dct:identifier "420abf2b-6351-4fe3-8a7d-d5dbf8ad67db" ;
    dct:issued "2026-04-28T09:49:03.475054"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-04-28T10:06:41.499419"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "ฐานข้อมูลความหลากหลายทางพันธุกรรมในประชากรไทย" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:keyword "Aggregated data",
        "Allele frequencies",
        "Database",
        "Rare variants",
        "ThaiGeR",
        "Variant" ;
    dcat:landingPage <https://thaiger.genomicsthailand.com> .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66> a dcat:Dataset ;
    dct:description "เป็นชุดข้อมูลจีโนมอ้างอิงเวอร์ชัน GRCh38 ที่ใช้ในกระบวนการค้นหาความหลากหลายทางพันธุกรรมของโครงการจีโนมิกส์ประเทศไทย 50,000 ราย โดยเป็นข้อมูลมาตรฐานจาก GATK_Bundle" ;
    dct:identifier "46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66" ;
    dct:issued "2026-08-31T08:43:19.271285"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-08-31T09:29:31.062595"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "จีโนมอ้างอิงมนุษย์ (GRCh38)" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:distribution <https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66/resource/07de2c35-f4b4-4ec6-adea-94c18920589f>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66/resource/1cdc7f4c-01f5-4925-bc8d-4b038a05b381>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66/resource/490287fa-0c91-4f5f-a017-38c95e516bc2>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66/resource/4d15aec9-7bc3-424b-b501-7f9c39b1e0dd>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66/resource/aa671066-db08-4b0f-8a3d-17c8143987e8>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66/resource/c4aabf6a-3c87-43af-a4a6-6cc1d817eeb0> ;
    dcat:keyword "GATK_Bundle",
        "GRCh38",
        "GRCh38+decoy genomes",
        "Reference genome" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66/resource/07de2c35-f4b4-4ec6-adea-94c18920589f> a dcat:Distribution ;
    dct:description "Reference human sequence GRCh38 with decoy genomes ในรูปแบบ FASTA file" ;
    dct:format "fasta" ;
    dct:issued "2026-08-31T08:46:55.434725"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-08-31T08:55:29.817732"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "resources-broad-hg38-v0-Homo_sapiens_assembly38.fasta" ;
    dcat:accessURL <https://s3-gvcf.genomicsthailand.com/public/GATK_Bundle/GRCh38/resources-broad-hg38-v0-Homo_sapiens_assembly38.fasta> .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66/resource/1cdc7f4c-01f5-4925-bc8d-4b038a05b381> a dcat:Distribution ;
    dct:description "Gold Standard INDELs data set สำหรับใช้ในกระบวนการ GATK Base Quality Scores Recalibration (BQSR) และ GATK VariantRecalibrator (VQSR)" ;
    dct:format "vcf.gz" ;
    dct:issued "2026-08-31T08:55:29.841475"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-08-31T09:25:45.951329"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "resources-broad-hg38-v0-Mills_and_1000G_gold_standard.indels.hg38.vcf.gz" ;
    dcat:accessURL <https://s3-gvcf.genomicsthailand.com/public/GATK_Bundle/GRCh38/resources-broad-hg38-v0-Mills_and_1000G_gold_standard.indels.hg38.vcf.gz> ;
    dcat:mediaType "text/vcard" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66/resource/490287fa-0c91-4f5f-a017-38c95e516bc2> a dcat:Distribution ;
    dct:description "ชุดข้อมูล dbSNP v138 ทั้ง SNPs และ INDELs สำหรับใช้ในกระบวนการ GATK VariantRecalibrator (VQSR)" ;
    dct:format "vcf.gz" ;
    dct:issued "2026-08-31T09:16:09.006749"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-08-31T09:26:36.482996"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "resources-broad-hg38-v0-Homo_sapiens_assembly38.dbsnp138.vcf.gz" ;
    dcat:accessURL <https://s3-gvcf.genomicsthailand.com/public/GATK_Bundle/GRCh38/resources-broad-hg38-v0-Homo_sapiens_assembly38.dbsnp138.vcf.gz> ;
    dcat:mediaType "text/vcard" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66/resource/4d15aec9-7bc3-424b-b501-7f9c39b1e0dd> a dcat:Distribution ;
    dct:description "Data set HapMap SNPs สำหรับใช้ในกระบวนการ GATK VariantRecalibrator (VQSR)" ;
    dct:format "vcf.gz" ;
    dct:issued "2026-08-31T09:18:07.865951"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-08-31T09:26:36.483157"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "resources-broad-hg38-v0-hapmap_3.3.hg38.vcf.gz" ;
    dcat:accessURL <https://s3-gvcf.genomicsthailand.com/public/GATK_Bundle/GRCh38/resources-broad-hg38-v0-hapmap_3.3.hg38.vcf.gz> ;
    dcat:mediaType "text/vcard" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66/resource/aa671066-db08-4b0f-8a3d-17c8143987e8> a dcat:Distribution ;
    dct:description "Data set OMNI 2.5 สำหรับใช้ในกระบวนการ GATK VariantRecalibrator (VQSR)" ;
    dct:format "vcf.gz" ;
    dct:issued "2026-08-31T09:21:16.504460"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-08-31T09:23:48.518904"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "resources-broad-hg38-v0-1000G_omni2.5.hg38.vcf.gz" ;
    dcat:accessURL <https://s3-gvcf.genomicsthailand.com/public/GATK_Bundle/GRCh38/resources-broad-hg38-v0-1000G_omni2.5.hg38.vcf.gz> ;
    dcat:mediaType "text/vcard" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/46445aa5-8366-4061-bdb2-baff45c1da66/resource/c4aabf6a-3c87-43af-a4a6-6cc1d817eeb0> a dcat:Distribution ;
    dct:description "Data set 100G phase 1 High confidence SNPs สำหรับใช้ในกระบวนการ GATK VariantRecalibrator" ;
    dct:format "vcf.gz" ;
    dct:issued "2026-08-31T09:23:48.541937"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-08-31T09:24:54.079639"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "resources-broad-hg38-v0-1000G_phase1.snps.high_confidence.hg38.vcf.gz" ;
    dcat:accessURL <https://s3-gvcf.genomicsthailand.com/public/GATK_Bundle/GRCh38/resources-broad-hg38-v0-1000G_phase1.snps.high_confidence.hg38.vcf.gz> ;
    dcat:mediaType "text/vcard" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/5979bc2c-708e-4a0e-a808-c1d554eb5b61> a dcat:Dataset ;
    dct:description "เป็นข้อมูลความหลากหลายทางพันธุกรรมขนาดเล็ก (short variants) จากอาสาสมัครแต่ละราย ที่ผ่านกระบวนการหาความหมายและความสำคัญ (Annotation) โดยใช้ซอฟต์แวร์ VEP ร่วมกับ dbNSFP และ TAPES (ACMG classification) และเปรียบเทียบกับฐานข้อมูล gnomAD จำนวน 50,000 ราย" ;
    dct:identifier "5979bc2c-708e-4a0e-a808-c1d554eb5b61" ;
    dct:issued "2026-04-28T07:20:16.121782"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-04-28T09:22:01.323025"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "Annotated Short Variants (BED)" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:keyword "Anootation",
        "BED",
        "Consequence",
        "Impact",
        "Individual data",
        "Short variant",
        "VEP",
        "dnNSFP",
        "gnomAD" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/5ccd8451-0971-4955-8974-e3539ecaaf98> a dcat:Dataset ;
    dct:description "เป็นข้อมูลความหลากหลายทางพันธุกรรมขนาดใหญ่ระดับโครงสร้าง (structural variants) จากอาสาสมัครแต่ละราย ค้นหาโดยใช้ซอฟต์แวร์ Manta เทียบกับจีโนมอ้างอิง GRCh38 อยู่ในรูปแบบ VCF เวอร์ชัน 4.2 จำนวน 50,000 ราย" ;
    dct:identifier "5ccd8451-0971-4955-8974-e3539ecaaf98" ;
    dct:issued "2026-04-28T07:25:48.594128"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-04-28T09:20:51.455406"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "Structural variant (VCF)" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:keyword "Individual data",
        "Manta",
        "Structural variant",
        "VCF" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/5d683012-6271-473b-b19e-eb23f1f6016d> a dcat:Dataset ;
    dct:description """ชุดข้อมูลที่รวบรวมความหลากหลายทางพันธุกรรมแบบ Short variants (SNV และ INDEL) ทั่วจีโนม จากข้อมูล WGS ของประชากรไทย จำนวน 50,000 ราย \r
\r
โดยประมวลผลเพื่อค้นหาความหลากหลายทางพันธุกรรมแบบ SNV และ INDEL โดยใช้ GATK4 best practice เทียบกับจีโนมอ้างอิงมาตรฐาน GRCh38 + decoy genomes (โครโมโซมคู่ที่ 1-22, X และ Y) \r
\r
ดำเนินการประมวลผลเพื่อหา Genotype ระดับประชากรด้วย Software GraphTyper  ทำการคัดกรอง Genotype รายบุคคลที่น่าเชื่อถือ โดยต้องมี 5 < DP < 400 และ GQ > 20; ถ้าข้อมูลไม่ตรงตามนี้จะถือเป็น Missing genotype ( . )\r
\r
เมื่อได้ข้อมูล Population scale Genotype ทั้ง 50,000 รายแลัวจะทำการคัดกรองความสัมพันธ์ทางสายเลือด ด้วย IBD (Identity-by-Descent) โดยตัดรายที่มีความสัมพันธ์ตั้งแต่ 3rd degree ออก (3rd degree, 2nd degree, FS, PO, Dup/MZ) คงเหลือ 40,314 ราย และสุดท้ายทำการประมวลผลข้อมูลเพื่อคำนวณความถี่อัลลีลโดยใช้ BCFTools""" ;
    dct:identifier "5d683012-6271-473b-b19e-eb23f1f6016d" ;
    dct:issued "2026-08-17T08:16:47.956653"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-08-21T02:45:12.256581"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "ความถี่อััลลีลจากความหลากหลายทางพันธุกรรมทั่วจีโนมในประชากรไทย" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:distribution <https://data.genomicsthailand.com/dataset/5d683012-6271-473b-b19e-eb23f1f6016d/resource/98847ae0-0ec0-4c59-a97c-9f3972b5da50>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/5d683012-6271-473b-b19e-eb23f1f6016d/resource/b49ed2ea-6f7a-4e38-9f75-c3cc65e41b7f>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/5d683012-6271-473b-b19e-eb23f1f6016d/resource/dbae4b73-c059-4dc3-bc3b-ebbe7b0684dd>,
        <https://data.genomicsthailand.com/dataset/5d683012-6271-473b-b19e-eb23f1f6016d/resource/f35e1253-7fc9-45f7-931a-af47e5c701c5> ;
    dcat:keyword "Aggregated Frequency",
        "Allele Frequency",
        "INDEL",
        "SNP",
        "SNV",
        "Short variants",
        "WGS" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/5d683012-6271-473b-b19e-eb23f1f6016d/resource/98847ae0-0ec0-4c59-a97c-9f3972b5da50> a dcat:Distribution ;
    dct:description "Index file" ;
    dct:format "vcf.gz.tbi" ;
    dct:issued "2026-08-17T08:25:20.690440"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-08-17T09:12:54.252417"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "Variants_GeTH50k_allChr.GRCh38.vcf.gz.tbi" ;
    dcat:accessURL <https://s3-gvcf.genomicsthailand.com/public/Variants_GeTH50k_allChr.GRCh38.vcf.gz.tbi> .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/5d683012-6271-473b-b19e-eb23f1f6016d/resource/b49ed2ea-6f7a-4e38-9f75-c3cc65e41b7f> a dcat:Distribution ;
    dct:format "text" ;
    dct:issued "2026-08-17T09:12:54.286801"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-08-21T02:15:48.203433"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "Variants_GeTH50k_allChr.md5sum.txt" ;
    dcat:accessURL <https://s3-gvcf.genomicsthailand.com/public/Variants_GeTH50k_allChr.md5sum.txt> ;
    dcat:mediaType "text/plain" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/5d683012-6271-473b-b19e-eb23f1f6016d/resource/dbae4b73-c059-4dc3-bc3b-ebbe7b0684dd> a dcat:Distribution ;
    dct:description """ข้อมูล GeTH Aggregated\r
\r
AN_TH : Total alleles (Maximum 80,628 from 40,314 unrelated Thais)\r
\r
AC_TH : Number of alternative alleles\r
\r
AF_TH : Alternative allele frequency\r
""" ;
    dct:format "VCF" ;
    dct:issued "2026-08-21T02:15:48.236029"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-08-21T02:19:07.612714"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "ตัวอย่างข้อมูล Aggregated Allele Frequency" ;
    dcat:accessURL <https://data.genomicsthailand.com/dataset/5d683012-6271-473b-b19e-eb23f1f6016d/resource/dbae4b73-c059-4dc3-bc3b-ebbe7b0684dd/download/example_geth_variants.txt> ;
    dcat:byteSize "3139"^^xsd:nonNegativeInteger ;
    dcat:mediaType "text/plain" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/5d683012-6271-473b-b19e-eb23f1f6016d/resource/f35e1253-7fc9-45f7-931a-af47e5c701c5> a dcat:Distribution ;
    dct:format "vcf.gz" ;
    dct:issued "2026-08-17T08:22:50.208888"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-08-17T08:25:20.650461"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "Variants_GeTH50k_allChr.GRCh38.vcf.gz" ;
    dcat:accessURL <https://s3-gvcf.genomicsthailand.com/public/Variants_GeTH50k_allChr.GRCh38.vcf.gz> ;
    dcat:mediaType "text/vcard" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/6a1a5bf8-bae3-4b43-9d4f-226b92f94ff1> a dcat:Dataset ;
    dct:description "เป็นข้อมูลความหลากหลายทางพันธุกรรมขนาดใหญ่ระดับโครงสร้าง (structural variants) จากอาสาสมัครแต่ละราย ที่ผ่านกระบวนการหาความหมายและความสำคัญโดยใช้ซอฟต์แวร์ AnnotSV จำนวน 50,000 ราย" ;
    dct:identifier "6a1a5bf8-bae3-4b43-9d4f-226b92f94ff1" ;
    dct:issued "2026-04-28T07:30:05.075929"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-04-28T09:17:30.381628"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "Annotated Structural Variant (TSV)" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:keyword "AnnotSV",
        "Annotation",
        "Individual data",
        "Structural variant",
        "TSV" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/7801e1c8-c8fb-4e38-bc4a-f3f6900052e2> a dcat:Dataset ;
    dct:description "เป็นข้อมูลที่ได้จากการถอดลำดับพันธุกรรมทั่วจีโนมแบบสายสั้น (short reads WGS) ของอาสาสมัครแต่ละราย จำนวน 50,000 ราย ใช้เทคโนโลยี MGI DNBSEQ-T7 โดยเป็นข้อมูลดิบ (Raw data) จัดเก็บในรูปแบบ FASTQ และข้อมูลที่ไปเทียบกับจีโนมอ้างอิงจัดเก็บในรูปแบบของ BAM file" ;
    dct:identifier "7801e1c8-c8fb-4e38-bc4a-f3f6900052e2" ;
    dct:issued "2026-04-28T06:57:41.802046"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-04-28T09:27:56.820252"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "WGSs (FASTQ/BAM)" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:keyword "BAM",
        "FASTQ",
        "Paired-end",
        "Short read WGS" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/79952607-1c19-4a78-b16d-f84ea94a99a5> a dcat:Dataset ;
    dct:description "ผลประเมินภาพรวมค่าสถิติของการ call short variants โดยใช้ GATK CollectVatiantMetrics และรวมผลโดยใช้ MultiQC" ;
    dct:identifier "79952607-1c19-4a78-b16d-f84ea94a99a5" ;
    dct:issued "2026-09-09T15:12:14.352134"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-09-09T15:14:57.843108"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "ค่าสถิติของการ call short variants" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:distribution <https://data.genomicsthailand.com/dataset/79952607-1c19-4a78-b16d-f84ea94a99a5/resource/7ad391c9-b77f-4486-a6ce-13526eced3a9> ;
    dcat:keyword "CollectVariantMetrics",
        "ความหลากหลายทางพันธุกรรม",
        "คุณภาพ",
        "สถิติ" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/79952607-1c19-4a78-b16d-f84ea94a99a5/resource/7ad391c9-b77f-4486-a6ce-13526eced3a9> a dcat:Distribution ;
    dct:description "ผลประเมินค่าสถิติจากการ call short variants จาก GATK CollectVariantMetrics และรวมผลด้วย MultiQC" ;
    dct:format "XLXS" ;
    dct:issued "2026-09-09T15:13:47.363666"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-09-09T15:13:47.328442"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "multiqc_general_stats.xlsx" ;
    dcat:accessURL <https://data.genomicsthailand.com/dataset/79952607-1c19-4a78-b16d-f84ea94a99a5/resource/7ad391c9-b77f-4486-a6ce-13526eced3a9/download/multiqc_general_stats.xlsx> ;
    dcat:byteSize "3277099"^^xsd:nonNegativeInteger ;
    dcat:mediaType "application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/828b8d9c-68b7-4042-8d5f-83da10f46024> a dcat:Dataset ;
    dct:description "แสดงรายชื่อโครงการวิจัยภายใต้แผนปฏิบัติการบูรณาการจีโนมิกส์ประเทศไทย กลุ่มโรค และจำนวนอาสาสมัครในโครงการที่ทำ WGS แล้วรวม 50,000 ราย" ;
    dct:identifier "828b8d9c-68b7-4042-8d5f-83da10f46024" ;
    dct:issued "2026-05-02T05:44:20.253832"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-05-18T08:36:13.729391"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "รายชื่อโครงการและจำนวนอาสาสมัครที่มีข้อมูล WGS" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:distribution <https://data.genomicsthailand.com/dataset/828b8d9c-68b7-4042-8d5f-83da10f46024/resource/a38f46e9-e2f3-4d52-a2ab-9194b4d8742c> ;
    dcat:keyword "Research Project",
        "WGS",
        "อาสาสมัคร" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/828b8d9c-68b7-4042-8d5f-83da10f46024/resource/a38f46e9-e2f3-4d52-a2ab-9194b4d8742c> a dcat:Distribution ;
    dct:description "แสดงรายชื่อโครงการวิจัยภายใต้แผนปฏิบัติการบูรณาการจีโนมิกส์ประเทศไทย กลุ่มโรค และจำนวนอาสาสมัครในโครงการที่ทำ WGS แล้วรวม 50,000 ราย" ;
    dct:format "XLSX" ;
    dct:issued "2026-05-02T05:44:56.089998"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-05-18T08:36:13.742123"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "รายชื่อโครงการวิจัยและจำนวนอาสาสมัครที่ทำ WGS" ;
    spdx:checksum [ a spdx:Checksum ;
            spdx:checksumValue "17d7f1fde382edf1d6b140c4ee00affa"^^xsd:hexBinary ] ;
    dcat:accessURL <https://data.genomicsthailand.com/dataset/828b8d9c-68b7-4042-8d5f-83da10f46024/resource/a38f46e9-e2f3-4d52-a2ab-9194b4d8742c/download/geth_with_wgss_lastest.xlsx> ;
    dcat:byteSize "28393"^^xsd:nonNegativeInteger ;
    dcat:mediaType "application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/97dc8c33-d2af-4d75-828c-3e9b8c98b993> a dcat:Dataset ;
    dct:description "เป็นข้อมูลความหลากหลายทางพันธุกรรมขนาดเล็ก (short variants) จากอาสาสมัครแต่ละราย ค้นหาโดยใช้ซอฟต์แวร์ GATK4 เทียบกับจีโนมอ้างอิง GRCh38 อยู่ในรูปแบบ VCF เวอร์ชัน 4.2 โดยจัดเก็บข้อมูลเฉพาะตำแหน่งที่เป็นความหลากหลายทางพันธุกรรม (polymorphic) เท่านั้น จำนวน 50,000 ราย" ;
    dct:identifier "97dc8c33-d2af-4d75-828c-3e9b8c98b993" ;
    dct:issued "2026-04-28T07:16:07.741282"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-04-28T09:23:03.690108"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "Short variant (VCF)" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:keyword "INDEL",
        "Individual data",
        "SNP",
        "Short variant",
        "VCF",
        "Variant" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/caa0f4f7-d88d-4bc5-b5bf-6f467b0598f4> a dcat:Dataset ;
    dct:description "เป็นข้อมูลความหลากหลายทางพันธุกรรมที่พบในประชากรไทยโดยมีการสร้างความสัมพันธ์กับกลุ่มโรคทางพันธุกรรมและยีนที่เกี่ยวข้อง ให้บริการผ่านฐานข้อมูลออนไลน์ในรูปแบบ Sun burst เพื่อสนับสนุนนักวิจัยในการสำรวจความหลากหลายทางพันธุกรรมที่สัมพันธ์กับโรคในประชากรไทย" ;
    dct:identifier "caa0f4f7-d88d-4bc5-b5bf-6f467b0598f4" ;
    dct:issued "2026-04-28T10:06:20.447083"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-04-28T10:06:20.447095"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "ข้อมูลความหลากหลายทางพันธุกรรมที่สัมพันธ์กับโรค" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:keyword "Allele frequencies",
        "Genetic diseases",
        "Variant",
        "burden" ;
    dcat:landingPage <้https://thxad.genomicsthailand.com> .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/decc3669-a189-49cd-80f7-b463d6941184> a dcat:Dataset ;
    dct:description "เป็นข้อมูลความหลากหลายทางพันธุกรรมขนาดเล็ก (short variants) จากอาสาสมัครแต่ละราย ค้นหาโดยใช้ซอฟต์แวร์ GATK4 เทียบกับจีโนมอ้างอิง GRCh38 อยู่ในรูปแบบ VCF เวอร์ชัน 4.2 โดยมีข้อมูลทั้งส่วนที่เป็นความหลากหลายทางพันธุกรรม (polymorphic) และส่วนที่เหมือนกับจีโนมอ้างอิง (non-polymorphic) จำนวน 50,000 ราย" ;
    dct:identifier "decc3669-a189-49cd-80f7-b463d6941184" ;
    dct:issued "2026-04-26T07:24:25.940878"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-04-28T09:24:16.450870"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "Short variant (GVCF)" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:keyword "GVCF",
        "Individual data",
        "Short variant",
        "Variant" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/e22d7806-6bff-4e5d-b29e-de7705a297b7> a dcat:Dataset ;
    dct:description "ชุดข้อมูลทางคลินิก และข้อมูลฟีโนไทป์ของอาสาสมัครในโครงการจีโนมิกส์ประเทศไทยจำนวน 50,000 ราย" ;
    dct:identifier "e22d7806-6bff-4e5d-b29e-de7705a297b7" ;
    dct:issued "2026-04-26T06:10:14.990518"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-08-15T15:26:29.518967"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "Phenotype & Clinical Data" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:keyword "CRF",
        "Clinical Data",
        "Cohort Builder",
        "Phenotype" ;
    dcat:landingPage <https://cohort.genomicsthailand.com> .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/e895fdc3-0853-40c8-a5b2-64ba8b274add> a dcat:Dataset ;
    dct:description "เป็นข้อมูลความหลากหลายทางพันธุกรรมขนาดเล็ก (short variant) ทั้ง SNP และ INDEL โดยรวมข้อมูลจีโนไทป์ระดับประชากรขนาดใหญ่จำนวน 50,000 ราย โดยใช้ซอฟต์แวร์ graphtyper" ;
    dct:identifier "e895fdc3-0853-40c8-a5b2-64ba8b274add" ;
    dct:issued "2026-04-26T07:13:24.335569"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-04-28T09:14:01.994377"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "Population-scaled Genotype" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:keyword "Genotype",
        "PLINK",
        "Population-scaled",
        "SNP",
        "Short variant",
        "VCF" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/f3bf03c8-9c0f-4c36-92a0-53742064c8ab> a dcat:Dataset ;
    dct:description "ผลการประเมินคุณภาพของการ call short variants ทั้ง 50,000 ราย โดยใช้ GATK CollectVariantMetrics" ;
    dct:identifier "f3bf03c8-9c0f-4c36-92a0-53742064c8ab" ;
    dct:issued "2026-09-09T15:04:39.799754"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-09-09T15:08:03.195269"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "Short Variant Quality" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:distribution <https://data.genomicsthailand.com/dataset/f3bf03c8-9c0f-4c36-92a0-53742064c8ab/resource/6b1fcdae-5a77-46ed-a250-11818b85fa91> ;
    dcat:keyword "CollectVariantMetrics",
        "Variants",
        "ความหลากหลายทางพันธุกรรม",
        "คุณภาพ" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/f3bf03c8-9c0f-4c36-92a0-53742064c8ab/resource/6b1fcdae-5a77-46ed-a250-11818b85fa91> a dcat:Distribution ;
    dct:description "ผลประเมินคุณภาพของการ call short variants โดยใช้ GATK CollectVariantMetrics และรวมข้อมูลด้วย MultiQC" ;
    dct:format "XLSX" ;
    dct:issued "2026-09-09T15:06:46.713678"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-09-09T15:08:02.661387"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "multiqc_variantCalling.xlsx" ;
    spdx:checksum [ a spdx:Checksum ;
            spdx:checksumValue "5036bf08d502d6787ba2f25bfad80808"^^xsd:hexBinary ] ;
    dcat:accessURL <https://data.genomicsthailand.com/dataset/f3bf03c8-9c0f-4c36-92a0-53742064c8ab/resource/6b1fcdae-5a77-46ed-a250-11818b85fa91/download/multiqc_variantcalling.xlsx> ;
    dcat:byteSize "12317278"^^xsd:nonNegativeInteger ;
    dcat:mediaType "application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/f810c59f-8525-4d07-a735-06fdbc922f66> a dcat:Dataset ;
    dct:description "ชุดข้อมูลรวบรวมคุณภาพของการสกัดอีเอ็นเอจากตัวอย่างเลือดของอาสาสมัคร 50,000 ราย ในโครงการจีโนมิกส์ประเทศไทย" ;
    dct:identifier "f810c59f-8525-4d07-a735-06fdbc922f66" ;
    dct:issued "2026-04-26T07:22:23.299717"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-09-05T17:35:09.720218"^^xsd:dateTime ;
    dct:publisher <https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> ;
    dct:title "DNA Quality" ;
    dcat:contactPoint [ a vcard:Organization ;
            vcard:fn "สวทช." ;
            vcard:hasEmail <mailto:chumpol.nga@biotec.or.th> ] ;
    dcat:distribution <https://data.genomicsthailand.com/dataset/f810c59f-8525-4d07-a735-06fdbc922f66/resource/e2e33b52-b1e7-4a0c-8526-b12840bd4971> ;
    dcat:keyword "DNA",
        "QC" .

<https://data.genomicsthailand.com/dataset/f810c59f-8525-4d07-a735-06fdbc922f66/resource/e2e33b52-b1e7-4a0c-8526-b12840bd4971> a dcat:Distribution ;
    dct:format "XLSX" ;
    dct:issued "2026-09-05T17:33:18.683854"^^xsd:dateTime ;
    dct:modified "2026-09-05T17:35:09.731326"^^xsd:dateTime ;
    dct:title "DNASubstanceQuality.xlsx" ;
    spdx:checksum [ a spdx:Checksum ;
            spdx:checksumValue "127dbf5615535e2bc8d9adcb3fe46656"^^xsd:hexBinary ] ;
    dcat:accessURL <https://data.genomicsthailand.com/dataset/f810c59f-8525-4d07-a735-06fdbc922f66/resource/e2e33b52-b1e7-4a0c-8526-b12840bd4971/download/dnasubstancequality.xlsx> ;
    dcat:byteSize "2908818"^^xsd:nonNegativeInteger ;
    dcat:mediaType "application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet" .

<https://research.genomicsthailand.com> a foaf:Document .

<https://thaiger.genomicsthailand.com> a foaf:Document .

<้https://thxad.genomicsthailand.com> a foaf:Document .

<https://data.genomicsthailand.com/organization/ef5fd2c7-479e-4d0e-a8ba-297ec78ebadb> a foaf:Agent ;
    foaf:name "Genomics Thailand" .

